Les racines de l'Aïkibudo sont triples : 

L'enseignement de l'Aïkibudo est essentiellement construit sur la base du programme de l'école Yoseikan Shintô Ryu de Maître Minoru Mochizuki, développé, complété et enrichi par Maître Alain Floquet.

De plus, l'Aïkibudo intègre complètement des techniques ancestrales des guerriers japonais provenant de deux arts martiaux historiquement attestés et reconnus : le Daïto Ryu Aikijujutsu, pour les techniques de défense à mains nues, qui fut transmis à Me Floquet par Maître Tokimune Takeda, et le Katori Shintô Ryu pour l'art des armes qui fut enseigné à Me Floquet par Maître Yoshio Sugino.

Maître Floquet respecte et honore ainsi l'enseignement originel qu'il a reçu de ces trois grands maîtres, dépositaires du patrimoine  japonais dans le domaine des arts martiaux, tout en apportant une évolution dynamique et originale, fruit de son travail et de sa recherche personnelle (adaptation de techniques dangereuses en préservant leur principe actif, parallélisme entre techniques manuelles et pratique des armes etc.). Un héritage et un développement qu’il synthétise dans la vision suivante :

«Le Daïto Ryu Aikijujutsu et le Katori Shintô Ryu sont les deux berges d'un fleuve, dont le Yoseikan Shintô Ryu est le lit et dans lequel s'écoule l'Aïkibudo. Les berges de ce fleuve sont  les rails de la tradition et l'Aikibudo le flux de la modernité»